Berdirinya SMA Negeri 1 Ngemplak diperkirakan pada tanggal 21 Januari 1997. Lokasi sekolah berada di Jalan Jangkang-Manisrenggo KM.2, Bimomartani, Ngemplak, Sleman, Yogyakarta, dengan luas wilayah keseluruhan 8002m persegi. Pada hingga saat ini sudah terdapat 6 Kepala Sekolah yang menjabat di SMA Negeri 1 Ngemplak.
Kepala Sekolah pertama Bapak Muh Bardi.
Kepala Sekolah kedua Bapak Sukisno,S.Pd periode 1998 – 2001
Kepala Sekolah ketiga Bapak Drs Mawardi periode 2001 – 2004
Kepala Sekolah keempat Bapak Drs Maskur periode 2004 – 2011
Kepala Sekolah kelima Bapak Darwito, S.Pd periode 2011 -2013
Kepala Sekolah keenam Bapak Basuki Jaka Purnama, M.Pd periode 2013 – November 2017
Kepala Sekolah ketujuh Bapak Drs. M.Warsun Latif periode November 2017 – Desember2020
Kepala Sekolah kedelapan Bapak Imam Puspadi S.Pd., M.Pd. Desember 2020 – hingga sekarang